通常，冷藏貨物可以分成兩種：冷藏和冷凍
許多冷藏貨物（例如水果）被視為是“活性（live）”貨物，因為其在采摘過后仍然能夠進行呼吸并且由于自熱、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他條件而容易腐爛。然而，其它商品比如冷藏肉/魚類和奶酪則并非如此。水果的低設(shè)定溫度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷凍貨物通常被認為是“惰性(inert)”貨物，一般在-18℃（0°F）或更低溫度下運載。既然冷藏和冷凍貨物都是易腐爛的，注意確保這類貨物以佳狀態(tài)交付。對于冷藏貨物，除了有限的幾種例外情況（比如肉，巧克力，膠片，化學物品，奶制品，人工氣調(diào)儲藏運輸貨物）外，其通風設(shè)備通常要保持開啟狀態(tài)。一些貨物可能要求濕度控制或者大量的新鮮空氣（比如球莖花卉）。應當注意大多數(shù)冷凍裝置僅能夠減少濕度，并且這取決于所提供的新鮮空氣的數(shù)量。人工氣調(diào)儲藏運輸?shù)呢浳镄枰褂媚軌蚶玫投趸继娲鯕馑降挠猛镜募b箱，來延長已采摘的產(chǎn)品的保質(zhì)期。這種方法適用于許多有核和無核水果，但要求具備的知識來確定適宜的氣體濃度水平。

冷藏集裝箱的貨物檢查，在裝箱之前應對冷藏水果和蔬菜的溫度以及冷凍貨物的中心溫度進行檢測。還應檢查水果和蔬菜是否存在比如發(fā)霉、枯萎、脫水、萎蔫、褪色、軟點、破皮和脫皮、擦傷、和發(fā)臭等冷藏前的損壞。對于冷凍貨物還應檢查其是否有脫水、干燥、移位、發(fā)臭、黑斑和顏色改變，以及是否有因溫度升高解凍后又重新冷凍的跡象。還應檢查紙箱、托盤和其他包裝物狀況是否良好，是否能夠在整個海運過程中保護貨物狀況。

冷藏集裝箱除了貨物的設(shè)定值和送風、回風溫度外，溫度控制系統(tǒng)還會以錯誤代碼的形式提供有關(guān)系統(tǒng)問題的詳細信息。貨物溫度可通過美國農(nóng)業(yè)部（USDA）探測儀記錄，安裝該探測儀是為了符合美國農(nóng)業(yè)部針對水果的運輸?shù)睦洳靥幚沓绦?。托運人放置于所載貨物中的數(shù)據(jù)記錄儀也會記錄大體溫度。當冷藏裝置失靈時，溫度顯示和數(shù)據(jù)記錄將會展示一個逐漸穩(wěn)定的溫度上升直至終達到周圍環(huán)境溫度值過程。再次強調(diào)，感應器只會記錄空氣溫度，而非貨物溫度。貨物將會受到周圍絕熱材料一定的保護，防止受到外部空氣溫度的影響。