尿素適用于一切作物和所有土壤，可用作基肥和追肥，旱水田均能施用。由于尿素在土壤中轉(zhuǎn)化可積累大量的銨離子，會導(dǎo)致pH升高2-3個單位，再加上尿素本身含有一定數(shù)量的縮二脲，其濃度在500ppm時，便會對作物幼根和幼芽起抑制作用，因此尿素不宜用作種肥。

根據(jù)《國家發(fā)展改革委關(guān)于緩釋肥料等執(zhí)行農(nóng)用化肥鐵路優(yōu)惠運價政策的通知》（發(fā)改價格〔2021〕1285號），尿素被列入《實行鐵路優(yōu)惠運價的農(nóng)用化肥品種目錄》，實施鐵路貨運優(yōu)惠。

水稻制種在雜交稻制種技術(shù)中，為了提高父母本的異交率，以增加雜交稻制種量或不育系繁種量，一般都采用赤毒素噴施母本以減輕母本包頸程度或使之完全抽出；或噴施父母本，調(diào)節(jié)二者的生長，使其花期同步。由于赤霉素價格較貴，用其制種成本高。人們用尿素代替赤霉素進行實驗，在孕穗盛期、始穗期（20%抽穗）使用1.5%-2%尿素，其繁種效果與赤霉素類似，且不會增加株高。

防治蟲害用尿素、洗衣粉、清水4:1:400份，攪拌混勻后，可防止果樹、蔬菜、棉花上的蚜蟲、紅蜘蛛、菜青蟲等害蟲，殺蟲效果達90%以上。

工業(yè)上還用作制造脲醛樹酯、聚氨酯、三聚氰胺-甲醛樹脂的原料,尿素加熱至200℃時生成固態(tài)的三聚氯酸(即氰尿酸)。三聚氰酸的衍生物三氯異氰尿酸、二氯異氰酸鈉、異氰尿酸三(2-羥乙酯)、異氰尿酸三(烯丙基)酯、三(3,5-二叔丁基-4-羥基芐基)異氰酸酯、異三聚氰酸三縮水甘油醚、氰尿酸三聚氰胺絡(luò)合物等有許多重要應(yīng)用。前兩者是新型消毒、漂白劑，三氯異氰尿酸全世界總所產(chǎn)能力超過8萬t。

選擇性催化還原(SCR)排氣后處理是通過尿素在燃燒排氣中熱解反應(yīng)產(chǎn)生的氨，來與汽車尾氣中的氮氧化物（NOx）進行選擇性催化還原反應(yīng)的一種技術(shù)，是降低燃燒鍋爐和柴油發(fā)動機等燃燒廢氣中的有害物質(zhì)NOx的關(guān)鍵而主流的技術(shù)。SCR系統(tǒng)是滿足現(xiàn)代汽車嚴格排放法規(guī)例如歐Ⅳ/歐V/ 歐VI（國IV/國V/國VI）法規(guī)的系統(tǒng)。車用尿素在歐洲叫AdBlue（添藍液），在美國叫DEF（柴油機排氣處理液）。