生物有機(jī)肥相比化肥的優(yōu)勢(shì)：生物有機(jī)肥營(yíng)養(yǎng)元素；化肥營(yíng)養(yǎng)元素只有一種或幾種。生物有機(jī)肥能夠改良土壤；化肥經(jīng)常使用會(huì)造成土壤板結(jié)。生物有機(jī)肥能提高產(chǎn)品品質(zhì)；化肥施用過(guò)多導(dǎo)致產(chǎn)品品質(zhì)低劣。生物有機(jī)肥能改善作物根際微生物群，提高植物的抗病蟲(chóng)能力；化肥則是作物微生物群體單一，易發(fā)生病蟲(chóng)害。生物有機(jī)肥能促進(jìn)化肥的利用，提高化肥利用率；化肥單使用易造成養(yǎng)分的固定和流失。

生物有機(jī)肥相比農(nóng)家肥的優(yōu)勢(shì)：生物有機(jī)肥完全腐熟，蟲(chóng)卵死亡率達(dá)到95%以上；農(nóng)家肥堆放簡(jiǎn)單，蟲(chóng)卵死亡率低。生物有機(jī)肥無(wú)臭；農(nóng)家肥有惡臭。生物有機(jī)肥施用方便，均勻；農(nóng)家肥施用不方便，肥料施用不均勻。
生物有機(jī)肥提高土壤孔隙度、通透交換性及植物成活率、增加有益菌和土壤微生物及種群。同時(shí)，在作物根系形成的優(yōu)勢(shì)有益菌群能抑制有害病原菌繁衍，增強(qiáng)作物抗逆抗病能力降低重茬作物的病情指數(shù)，連年施用可大大緩解連作障礙。生物有機(jī)肥回收利用農(nóng)業(yè)廢棄物，減少環(huán)境污染，對(duì)人、畜、環(huán)境安全、，是一種環(huán)保型肥料。
生物有機(jī)肥料營(yíng)養(yǎng)元素，能夠改良土壤，改善使用化肥造成的土壤板結(jié)。改善土壤理化性狀，增強(qiáng)土壤保水、保肥、供肥的能力。生物有機(jī)肥料中的有益微生物進(jìn)入土壤后與土壤中微生物形成相互間的共生增殖關(guān)系，抑制有害菌生長(zhǎng)并轉(zhuǎn)化為有益菌。
相互作用，相互促進(jìn)，起到群體的協(xié)同作用，有益菌在生長(zhǎng)繁殖過(guò)程中產(chǎn)生大量的代謝產(chǎn)物，促使有機(jī)物的分解轉(zhuǎn)化，能直接或間接為作物提供多種營(yíng)養(yǎng)和刺激性物質(zhì)，促進(jìn)和調(diào)控作物生長(zhǎng)。
以前，我們的“老農(nóng)”有一句口頭禪：“種地不上糞，全是瞎胡混”、“莊稼一支花，全靠肥當(dāng)家”。后來(lái)由于化肥沖擊市場(chǎng)，農(nóng)家肥用量越來(lái)越少，有的甚至是不用。也是由于化肥開(kāi)始使用時(shí)確實(shí)對(duì)作物增產(chǎn)起到明顯的作用，人們也就忽略了農(nóng)家肥的使用。