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雖然有機肥的成分種類較多，但是每種養(yǎng)分的含量相對較少，并且病菌較多。需要存放腐熟以殺滅病菌、并與化學(xué)肥料配合使用，效果更好。
隨著科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展，通過有益菌群的人工篩選、分離、馴化培養(yǎng)技術(shù)，將有益菌群接入無害化處理后有機肥中，可以生產(chǎn)出多種多樣不同品種的生物有機肥，它能改善土質(zhì)、減少環(huán)境污染、增肥增效等。
有機農(nóng)業(yè)中使用的有機肥需經(jīng)過有機認證機構(gòu)的認證，符合產(chǎn)品的生產(chǎn)標準。近些年來，我國各種生物肥料發(fā)展迅速，年產(chǎn)量達數(shù)十萬噸以上。這些生物肥料以科技含量較高、增產(chǎn)效果明顯和為主要特點，它的生產(chǎn)、推廣和應(yīng)用對增進土壤肥力，提高農(nóng)作物產(chǎn)量，改善農(nóng)作物品質(zhì)和切實推行農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展都有積極意義。 針對生物肥料在生產(chǎn)、產(chǎn)品質(zhì)量和使用等方面存在的問題，本刊記者采訪了江西農(nóng)業(yè)大學(xué)高勇生教授，旨在提高農(nóng)村廣大群眾對這類肥料的認識，更加正確、科學(xué)地使用這些肥料，以促進我國生物肥料的健康發(fā)展。

生物有機肥是指特定功用微生物與主要以動植物殘體(如畜禽糞便、農(nóng)作物秸稈等)為來歷并經(jīng)無害化處理、腐熟的有機物料復(fù)合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應(yīng)的肥料。和化肥比較，生物有機肥營養(yǎng)元素完全，具有改善土壤、進步產(chǎn)品品質(zhì)、改善作物根際微生物群、進步植物的抗病蟲才能、進步化肥使用率等特色，深受農(nóng)喜歡?？墒?，在近年來生物有機肥出產(chǎn)經(jīng)銷和實踐使用中，卻呈現(xiàn)了一系列亟待解決的問題，詳細如下：

生物有機肥巧鑒別 一看包裝，是否規(guī)范。包括產(chǎn)品登記證、產(chǎn)品技術(shù)指標、產(chǎn)品有效期； 二看物料，是否均勻。產(chǎn)品含水量太高或太低均不利于菌種存活，判斷方法：抓一把肥料在陽光下觀察，陰潮呈團、干燥呈灰都非正常產(chǎn)品。 三看效果，是否。試驗方法：加少量水將生物有機肥調(diào)成團狀，放在冰箱里凍成冰塊，第二天拿出來融化，反復(fù)三次，肥料中的菌種將會凍死或大幅度減少；這是用它和將原產(chǎn)品進行比較試驗、在相同的田塊里觀察差異，差異明顯是好肥料，差異不明顯，表明該產(chǎn)品有問題，建議放棄使用。

在對微生物肥料的知道方面，近幾年形成了較大誤區(qū)，農(nóng)人沒有真實知道生物有機肥，也就不能合理使用生物有機肥，然后降低了微生物肥料的名譽。

有機肥真假鑒別
1.泡水法
　　取一水杯，把有機肥樣品泡在水里，然后用手把泡在水里的有機肥碾碎，攪一下能直觀的看出有機肥的原料；再放置一段時間，如果有機肥與水短時間內(nèi)分層的話說明有機肥比重大，含土較多。
　　2.聞味法
　　仔細聞一下肥的味道看是否有氨味，糞便味，淤泥味，好的有機肥應(yīng)該是一種腐熟的味道。
　　3.手捻法
　　取有機肥用大拇指和食指來回碾壓，如果有硌手的感覺，則里面有沙?；蚱渌s質(zhì)。
　　4.菌種測試法
　　取一水杯把有機肥放在里面，撒少許水（注意不要泡水，潮濕就行），放在溫暖適宜的地方，好的有機肥會抱團長出白色菌絲，掰開有機肥顆粒會看到里面也有白色菌絲。
　　5.盆栽測試法
　　取一盆花，抓把有機肥直接撒在花的根莖部，澆上水，好的有機肥會逐漸長出白色菌絲，促進植株生長，質(zhì)量不合格的有機肥會熏苗，植株逐漸萎靡，直至。
　　6.對比試驗法
　　選擇好有機肥后在種植作物時，留出一部分不施用該有機肥，觀察植株的表現(xiàn)，好的有機肥在長勢、產(chǎn)量、品質(zhì)上都會有明顯的效果。 [5]

主要來源于植物和（或）動物，施于土壤以提供植物營養(yǎng)為其主要功能的含碳物料。經(jīng)生物物質(zhì)、動植物廢棄物、植物殘體加工而來，消除了其中的有毒有害物質(zhì)，富含大量有益物質(zhì)，包括：多種有機酸、肽類以及包括氮、磷、鉀在內(nèi)的豐富的營養(yǎng)元素。不僅能為農(nóng)作物提供全面營養(yǎng)，而且肥效長，可增加和更新土壤有機質(zhì)，促進微生物繁殖，改善土壤的理化性質(zhì)和生物活性，是綠色食品生產(chǎn)的主要養(yǎng)分廣義
俗稱農(nóng)家肥，包括以各種動物、植物殘體或代謝物組成，如人畜糞便、秸稈、動物殘體、屠宰場廢棄物等。
另外還包括餅肥（菜籽餅、棉籽餅、豆餅、芝麻餅、蓖麻餅、茶籽餅等）；堆肥；漚肥；廄肥；沼肥；綠肥等。
主要是以供應(yīng)有機物質(zhì)為手段，借此來改善土壤理化性能，促進植物生長及土壤生態(tài)系統(tǒng)的循環(huán)。