轉錄因子ChIP-seq整體服務
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轉錄因子ChIP-seq整體服務
發(fā)布時間:2017-09-13 09:40:24 | 瀏覽次數(shù):
項目簡介
基因的轉錄調控是生物基因表達調控層次中關鍵的一層,而轉錄因子是參與基因表達調控的一類重要的細胞核蛋白質。轉錄因子通過特異性結合調控區(qū)域的DNA序列來調控基因轉錄過程,因此在全基因組水平將轉錄因子定位于靶基因DNA是認識轉錄調控網(wǎng)絡的有效方法之一。
通過轉錄因子ChIP-Seq技術能夠揭示轉錄因子的結合位點和確定直接的靶基因序列,可在體內分析特定啟動子的分子調控機制。ChIP-Seq已廣泛應用于研究一些經(jīng)典轉錄因子和一些新的轉錄因子在全基因組上的結合情況,實現(xiàn)全基因組層面分析一些經(jīng)典的轉錄因子的調控網(wǎng)絡,或為新轉錄因子的功能研究提供一些線索。
表觀生物技術團隊具備豐富的ChIP實驗經(jīng)驗,利用經(jīng)驗證的ChIP級抗體,提供轉錄因子共沉淀服務,并結合新一代高通量測序技術,為生物醫(yī)學研究人員提供轉錄因子研究整體服務(ChIP-seq)。
項目流程 :
樣本要求:
人及大鼠或小鼠細胞
細胞量達到107個
組織樣本需評估
測序模式:
SE50
測序數(shù)據(jù)量:
20M
生物信息分析內容
一、標準信息分析
1. 去接頭污染,去低質量reads和測序質量評估
2. ChIP測序序列與參考基因組序列的比對
3. ChIP測序reads在全基因組的分布
4. Peak鑒定及基因原件分析
5. Peak相關基因篩選與GO功能聚類分析、Pathway分析
二、信息分析
可根據(jù)客戶的需求,定制信息分析內容。
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