冷藏集裝箱制冷裝置運行過程中，蒸發(fā)器盤管上會形成冰層，這取決于設(shè)定溫度、貨物溫度、通風(fēng)裝置的新風(fēng)量和貨物濕度。制冷裝置會定期進入除霜狀態(tài)，一系列電加熱裝置會產(chǎn)生熱量或向蒸發(fā)器盤管內(nèi)吹入熱空氣。此時所有風(fēng)扇將停止旋轉(zhuǎn)，以防止熱空氣進入貨艙。但是，由于回風(fēng)溫度傳感器位于制冷機組附近，因此可能會記錄溫度升高。因此，除非經(jīng)過數(shù)據(jù)記錄軟件處理，否則溫度記錄會顯示與除霜間隔一致的周期性溫升。如果除霜時間很短，每小時的溫度讀數(shù)和除霜時間可能會有一些差異。
冷藏集裝箱的陸上運輸工具中有溫控集裝箱的水運交通工具，以及運用更高運速的空中運輸工具。但是用戶在選擇以上三種運輸方式的時候，還應(yīng)該仔細去考慮冷藏運輸多少錢這個問題，因為只有在不斷的對比和分析當(dāng)中，才能選擇出適合自身的冷藏運輸方式。

冷凍集裝箱是一具有良好隔熱、氣密，且能維持一定低溫要求，適用于各類易腐食品的運送、貯存的集裝箱。
冷凍集裝箱一般在箱的前端部設(shè)有內(nèi)藏式冷凍裝置。在冷凍機工作時，冷風(fēng)從箱內(nèi)后端的通風(fēng)管吹出通過箱壁上凸條間的空隙和箱底的通風(fēng)導(dǎo)軌，經(jīng)前端壁上的冷風(fēng)吸，返回冷凍機進行回圈。為了提高冷卻效果，整個冷凍集裝箱的箱壁、箱頂和箱底內(nèi)部都鋪有絕緣材料。

為了解決集裝箱進出口不平衡的問題，船公司通常要向出口大于進口的地區(qū)調(diào)撥大量空箱。由于空箱的調(diào)撥要增加大量調(diào)撥成本，船公司在空箱調(diào)撥進口至空箱裝貨出口的過程中更應(yīng)加強集裝箱管理，避免超期箱的出現(xiàn)。在集裝箱運輸中空箱由進口到出口的整個流程可以歸結(jié)如下：
　冷藏集裝箱船舶進港→空箱卸船→碼頭堆存→集裝箱車隊拖箱→空箱進堆場→發(fā)貨人提箱→裝箱→重箱進港區(qū)→裝船。

冷藏集裝箱超期箱的清理及措施：超期箱的存在將增加船公司的經(jīng)營成本，降低資源有效利用率。因此船公司加強超期箱的管理，定期清理超期箱。船公司通常都有自己的集裝箱跟蹤系統(tǒng)，通過該系統(tǒng)可以查出目前本公司所有集裝箱的動態(tài)，從而可以查出超過期限的超期箱的詳細情況。通常船公司須每周清理一次超期箱，根據(jù)集裝箱跟蹤系統(tǒng)編制的超期箱清單逐一核查集裝箱超期的原因，然后同有關(guān)方聯(lián)系敦促其將超期箱盡快出運。