物種分類是體現(xiàn)性的鑒定環(huán)節(jié)。根據(jù)生物分類學(xué)體系，化石鑒定應(yīng)當(dāng)遵循從界、門、綱、目、科、屬到種的層級遞進原則，不可越級判斷。以三葉蟲化石為例，鑒定者需要依次觀察其頭部結(jié)構(gòu)、胸節(jié)數(shù)量、尾部形態(tài)等特征，逐步確定其分類位置。市場上常見的錯誤是僅憑局部相似就草率定種，導(dǎo)致大量鑒定錯誤。鑒定者會使用《中國各門類化石》等工具書進行比對，確保分類的準(zhǔn)確性。

舌羊齒屬等種子蕨的化石廣泛分布在南半球的數(shù)個大陸中，此一事實支持了阿爾弗雷德·魏格納所提出的大陸漂移學(xué)說。

通常如肌肉或表皮等柔軟部分在保存前就已腐蝕殆盡，而只留下抵抗性較大的部分，如骨頭或外殼。它們接著就被周圍沉積物的礦物質(zhì)所滲入取代。許多化石也被覆蓋其上的巖石重量壓平。