利用木瓜蛋白酶的酶促反應(yīng)，可把食品中大分子的蛋白質(zhì)水解成易于吸收的小分子肽或氨基酸，***適用于如：雞、豬、牛、海產(chǎn)品、血制品、大豆、花生等動(dòng)植物蛋白酶解、肉類嫩化劑、酒類澄清劑、餅干松化劑、面條穩(wěn)定劑、保健食品、醬油釀造及酒類發(fā)酵劑等，即可提高食品的營養(yǎng)價(jià)值，又可降***。

含木瓜蛋白酶的***，如木瓜潤喉片、木瓜腸溶片（膠囊）、木瓜含片，具有***、利膽、止痛、助消化、***等功效，進(jìn)一步研究表明亦可用于檢查紅細(xì)胞表面及血型鑒別劑、***婦科病、青光眼、昆蟲的叮咬等。

羊毛的防縮：用木瓜蛋白酶處理過的羊毛，其抗張度比常規(guī)方法高，毛線手感柔軟，舒適、抗收縮、抗張強(qiáng)度等效果收縮性為0；還可用于蠶的脫膠和蠶絲的精煉。

利用木瓜蛋白酶制成皮的脫毛劑，鞣制皮革，經(jīng)本品鞣制的皮革，毛孔細(xì)致光亮。分解飼料中蛋白質(zhì)成氨基酸，增加營養(yǎng)物質(zhì)的滲出量，利于家禽對蛋的吸收和利用，同時(shí)補(bǔ)充動(dòng)物內(nèi)源酶不足，提高飼料利用率及降低飼料***，增強(qiáng)食欲，進(jìn)而促進(jìn)動(dòng)物生長，提高日增重及成活力，還可以作為蔬菜水果復(fù)合肥料的添加劑。

此外還可加入加牙膏、漱口水、牙粉等,可清潔口腔，除去牙垢和牙結(jié)石，與其它溶劑配合可制成隱形眼鏡的清潔消毒劑以及感光膠片銀的回收等。

木瓜蛋白酶是蛋白水解酶。木瓜蛋白酶是番木瓜中含有低特異性蛋白水解酶,地存在于番木瓜的根、莖、葉和果實(shí)內(nèi)。木瓜蛋白酶的活性中心含半胱氨酸,屬于統(tǒng)基蛋白酶,它具有酶活高、熱穩(wěn)定性好、天ran衛(wèi)生安quan等特點(diǎn),因此在食品、飼料、日化、皮革及紡織等行業(yè)得到應(yīng)用。