變化為石。 元 鄭元祐《次韻劉憲副春日湖上有感》詩(shī)：“鶴老離巢松化石，鸞孤照水竹穿沙?！?明 劉基《雙帶子》曲之四：“天上星辰能化石，黃河千歲也還清。”；典出《初學(xué)記》卷五引 南朝 宋 劉義慶《幽明錄》：“ 武昌山 上有望夫石，狀若人立。古傳云：‘昔有貞婦，其夫從役，遠(yuǎn)赴國(guó)難，攜弱子餞送北山，立望夫而化為立石，因以為名焉?！?明 何景明《結(jié)腸賦》：“淚隕血而崩城兮，身立枯而化石。” 明 張煌言《得友人書(shū)道內(nèi)子艱難狀》詩(shī)：“漸來(lái)應(yīng)化石，遮莫但飛蓬?！?蘇曼殊《無(wú)題》詩(shī)之七：“分明化石心難定，多謝云娘十幅箋?！?br/>
《山海經(jīng)》也有“石魚(yú)”（即魚(yú)化石）的記述；南朝齊梁時(shí)期陶弘景有對(duì)琥珀中古昆蟲(chóng)的記述；宋朝沈括對(duì)螺蚌化石和杜綰對(duì)魚(yú)化石的起源，已有了正確認(rèn)識(shí)。迄今，發(fā)現(xiàn)早的細(xì)菌化石為距今35億年前的澳大利亞瓦拉翁納群中的絲狀細(xì)菌化石。

松柏和開(kāi)花植物的根、莖及枝干的化石可以在湖泊及海岸的中生代和新生代地層中被找到。加州紅木、木蘭、櫟樹(shù)和棕櫚樹(shù)等化石常被找到。
石化木普遍存在于世界的部份地區(qū)，且常在酸性及沙漠地區(qū)中所發(fā)現(xiàn)，因?yàn)槟切┑胤胶苋菀滓蚯治g作用而暴露。石化木通常都被嚴(yán)重地硅化（有機(jī)質(zhì)被二氧化硅取代），且生殖組織常會(huì)被保存在良好的狀態(tài)。此類(lèi)的樣本有些會(huì)使用寶石雕琢的裝置來(lái)切割及磨光。石化木的石化林已在每個(gè)大陸中被發(fā)現(xiàn)。